Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH70

XKR9, XK-related protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR9Q5GH70 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
XKR9Q5GH70 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
XKR9Q5GH70 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
XKR9Q5GH70 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
XKR9Q5GH70 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
XKR9Q5GH70 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
XKR9Q5GH70 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
XKR9Q5GH70 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
XKR9Q5GH70 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
XKR9Q5GH70 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
XKR9Q5GH70 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
XKR9Q5GH70 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
XKR9Q5GH70 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XKR9Q5GH70 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
XKR9Q5GH70 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
XKR9Q5GH70 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
XKR9Q5GH70 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
XKR9Q5GH70 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
XKR9Q5GH70 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
XKR9Q5GH70 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XKR9Q5GH70 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
XKR9Q5GH70 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
XKR9Q5GH70 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms