Protein–RNA interactions for Protein: Q5BIV9

SPRN, Shadow of prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRNQ5BIV9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPRNQ5BIV9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPRNQ5BIV9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SPRNQ5BIV9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SPRNQ5BIV9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SPRNQ5BIV9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms