Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKDCCQ504Y2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PKDCCQ504Y2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKDCCQ504Y2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKDCCQ504Y2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PKDCCQ504Y2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKDCCQ504Y2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PKDCCQ504Y2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PKDCCQ504Y2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PKDCCQ504Y2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PKDCCQ504Y2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PKDCCQ504Y2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PKDCCQ504Y2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKDCCQ504Y2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKDCCQ504Y2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PKDCCQ504Y2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKDCCQ504Y2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKDCCQ504Y2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKDCCQ504Y2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PKDCCQ504Y2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKDCCQ504Y2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKDCCQ504Y2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKDCCQ504Y2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PKDCCQ504Y2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKDCCQ504Y2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PKDCCQ504Y2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms