Protein–RNA interactions for Protein: Q496Y0

LONRF3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF3Q496Y0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
LONRF3Q496Y0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
LONRF3Q496Y0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LONRF3Q496Y0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
LONRF3Q496Y0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LONRF3Q496Y0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
LONRF3Q496Y0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LONRF3Q496Y0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LONRF3Q496Y0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LONRF3Q496Y0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LONRF3Q496Y0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LONRF3Q496Y0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LONRF3Q496Y0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LONRF3Q496Y0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
LONRF3Q496Y0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LONRF3Q496Y0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms