Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNF212Q495C1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RNF212Q495C1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RNF212Q495C1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RNF212Q495C1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RNF212Q495C1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF212Q495C1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF212Q495C1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RNF212Q495C1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RNF212Q495C1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF212Q495C1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF212Q495C1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RNF212Q495C1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF212Q495C1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RNF212Q495C1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RNF212Q495C1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms