Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCU0

Putative uncharacterized protein FLJ37770, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3ZCU0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3ZCU0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3ZCU0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3ZCU0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3ZCU0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3ZCU0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q3ZCU0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q3ZCU0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Q3ZCU0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Q3ZCU0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3ZCU0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q3ZCU0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Q3ZCU0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Q3ZCU0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3ZCU0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3ZCU0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3ZCU0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3ZCU0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Q3ZCU0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Q3ZCU0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Q3ZCU0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Q3ZCU0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Q3ZCU0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3ZCU0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Q3ZCU0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Q3ZCU0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3ZCU0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3ZCU0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3ZCU0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3ZCU0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Q3ZCU0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3ZCU0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Q3ZCU0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3ZCU0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3ZCU0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3ZCU0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Q3ZCU0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3ZCU0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3ZCU0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3ZCU0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Q3ZCU0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3ZCU0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3ZCU0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Q3ZCU0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3ZCU0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3ZCU0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3ZCU0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Q3ZCU0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms