Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY05

LINC00303, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00303, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00303Q3SY05 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00303Q3SY05 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00303Q3SY05 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00303Q3SY05 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00303Q3SY05 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00303Q3SY05 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00303Q3SY05 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00303Q3SY05 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00303Q3SY05 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00303Q3SY05 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00303Q3SY05 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00303Q3SY05 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00303Q3SY05 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00303Q3SY05 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00303Q3SY05 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LINC00303Q3SY05 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LINC00303Q3SY05 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00303Q3SY05 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms