Protein–RNA interactions for Protein: Q3MIT2

PUS10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS10Q3MIT2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PUS10Q3MIT2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PUS10Q3MIT2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PUS10Q3MIT2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PUS10Q3MIT2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PUS10Q3MIT2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PUS10Q3MIT2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PUS10Q3MIT2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PUS10Q3MIT2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PUS10Q3MIT2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PUS10Q3MIT2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PUS10Q3MIT2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PUS10Q3MIT2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PUS10Q3MIT2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PUS10Q3MIT2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUS10Q3MIT2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PUS10Q3MIT2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PUS10Q3MIT2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PUS10Q3MIT2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUS10Q3MIT2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUS10Q3MIT2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PUS10Q3MIT2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PUS10Q3MIT2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PUS10Q3MIT2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PUS10Q3MIT2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PUS10Q3MIT2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PUS10Q3MIT2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PUS10Q3MIT2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PUS10Q3MIT2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUS10Q3MIT2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUS10Q3MIT2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUS10Q3MIT2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUS10Q3MIT2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PUS10Q3MIT2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS10Q3MIT2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PUS10Q3MIT2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PUS10Q3MIT2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS10Q3MIT2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS10Q3MIT2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PUS10Q3MIT2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PUS10Q3MIT2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PUS10Q3MIT2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS10Q3MIT2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS10Q3MIT2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS10Q3MIT2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS10Q3MIT2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS10Q3MIT2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PUS10Q3MIT2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms