Protein–RNA interactions for Protein: Q3B8N5

PROX2, Prospero homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROX2Q3B8N5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PROX2Q3B8N5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PROX2Q3B8N5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PROX2Q3B8N5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PROX2Q3B8N5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROX2Q3B8N5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROX2Q3B8N5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROX2Q3B8N5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PROX2Q3B8N5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROX2Q3B8N5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROX2Q3B8N5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PROX2Q3B8N5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROX2Q3B8N5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROX2Q3B8N5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PROX2Q3B8N5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROX2Q3B8N5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROX2Q3B8N5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PROX2Q3B8N5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
PROX2Q3B8N5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PROX2Q3B8N5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PROX2Q3B8N5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PROX2Q3B8N5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PROX2Q3B8N5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PROX2Q3B8N5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PROX2Q3B8N5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms