Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCK2Q16822 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCK2Q16822 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PCK2Q16822 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PCK2Q16822 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PCK2Q16822 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms