Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NRF1Q16656 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NRF1Q16656 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRF1Q16656 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRF1Q16656 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NRF1Q16656 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NRF1Q16656 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRF1Q16656 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NRF1Q16656 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NRF1Q16656 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRF1Q16656 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRF1Q16656 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NRF1Q16656 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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NRF1Q16656 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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NRF1Q16656 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NRF1Q16656 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRF1Q16656 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NRF1Q16656 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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NRF1Q16656 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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NRF1Q16656 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
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NRF1Q16656 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NRF1Q16656 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NRF1Q16656 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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