Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKN1Q16512 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKN1Q16512 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PKN1Q16512 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PKN1Q16512 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKN1Q16512 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PKN1Q16512 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PKN1Q16512 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PKN1Q16512 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PKN1Q16512 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKN1Q16512 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKN1Q16512 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKN1Q16512 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PKN1Q16512 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PKN1Q16512 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKN1Q16512 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PKN1Q16512 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PKN1Q16512 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PKN1Q16512 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PKN1Q16512 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PKN1Q16512 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PKN1Q16512 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PKN1Q16512 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
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