Protein–RNA interactions for Protein: Q15835

GRK1, Rhodopsin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRK1Q15835 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRK1Q15835 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GRK1Q15835 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRK1Q15835 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRK1Q15835 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRK1Q15835 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRK1Q15835 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRK1Q15835 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRK1Q15835 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRK1Q15835 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRK1Q15835 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRK1Q15835 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRK1Q15835 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRK1Q15835 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRK1Q15835 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRK1Q15835 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRK1Q15835 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRK1Q15835 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRK1Q15835 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms