Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NCOA1Q15788 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
NCOA1Q15788 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
NCOA1Q15788 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
NCOA1Q15788 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NCOA1Q15788 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NCOA1Q15788 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NCOA1Q15788 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
NCOA1Q15788 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NCOA1Q15788 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
NCOA1Q15788 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NCOA1Q15788 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NCOA1Q15788 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NCOA1Q15788 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
NCOA1Q15788 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NCOA1Q15788 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
NCOA1Q15788 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
NCOA1Q15788 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
NCOA1Q15788 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NCOA1Q15788 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
NCOA1Q15788 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
NCOA1Q15788 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
NCOA1Q15788 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NCOA1Q15788 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
NCOA1Q15788 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
NCOA1Q15788 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
NCOA1Q15788 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.3■■■■□ 3.88
NCOA1Q15788 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
NCOA1Q15788 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
NCOA1Q15788 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
NCOA1Q15788 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
NCOA1Q15788 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
NCOA1Q15788 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
NCOA1Q15788 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
NCOA1Q15788 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
NCOA1Q15788 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
NCOA1Q15788 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NCOA1Q15788 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NCOA1Q15788 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NCOA1Q15788 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
NCOA1Q15788 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
NCOA1Q15788 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
NCOA1Q15788 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NCOA1Q15788 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NCOA1Q15788 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
NCOA1Q15788 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
NCOA1Q15788 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
NCOA1Q15788 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
NCOA1Q15788 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NCOA1Q15788 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NCOA1Q15788 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NCOA1Q15788 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NCOA1Q15788 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
NCOA1Q15788 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NCOA1Q15788 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NCOA1Q15788 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
NCOA1Q15788 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
NCOA1Q15788 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
NCOA1Q15788 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.14■■■■□ 3.86
NCOA1Q15788 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.11■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC39.09■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.08■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
NCOA1Q15788 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NCOA1Q15788 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
NCOA1Q15788 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.06■■■■□ 3.84
NCOA1Q15788 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
NCOA1Q15788 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.06■■■■□ 3.84
NCOA1Q15788 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC39.06■■■■□ 3.84
NCOA1Q15788 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
NCOA1Q15788 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
NCOA1Q15788 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
NCOA1Q15788 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.03■■■■□ 3.84
NCOA1Q15788 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
NCOA1Q15788 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
NCOA1Q15788 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
NCOA1Q15788 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
NCOA1Q15788 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
NCOA1Q15788 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC39■■■■□ 3.83
NCOA1Q15788 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
NCOA1Q15788 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.99■■■■□ 3.83
NCOA1Q15788 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
NCOA1Q15788 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
NCOA1Q15788 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
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