Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TTF1Q15361 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TTF1Q15361 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TTF1Q15361 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
TTF1Q15361 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TTF1Q15361 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TTF1Q15361 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TTF1Q15361 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TTF1Q15361 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TTF1Q15361 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TTF1Q15361 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TTF1Q15361 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
TTF1Q15361 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TTF1Q15361 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TTF1Q15361 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TTF1Q15361 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TTF1Q15361 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TTF1Q15361 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TTF1Q15361 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TTF1Q15361 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TTF1Q15361 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TTF1Q15361 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TTF1Q15361 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
TTF1Q15361 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TTF1Q15361 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TTF1Q15361 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
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