Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCN1Q15293 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCN1Q15293 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCN1Q15293 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCN1Q15293 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCN1Q15293 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCN1Q15293 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
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