Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCF4Q15080 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCF4Q15080 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCF4Q15080 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCF4Q15080 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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