Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCF4Q15080 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCF4Q15080 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
NCF4Q15080 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCF4Q15080 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCF4Q15080 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCF4Q15080 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NCF4Q15080 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCF4Q15080 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms