Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSPNQ14714 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SSPNQ14714 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSPNQ14714 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSPNQ14714 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SSPNQ14714 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSPNQ14714 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSPNQ14714 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSPNQ14714 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SSPNQ14714 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSPNQ14714 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SSPNQ14714 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SSPNQ14714 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SSPNQ14714 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SSPNQ14714 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SSPNQ14714 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SSPNQ14714 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SSPNQ14714 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSPNQ14714 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSPNQ14714 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSPNQ14714 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SSPNQ14714 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms