Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CACNA1SQ13698 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CACNA1SQ13698 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CACNA1SQ13698 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
CACNA1SQ13698 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CACNA1SQ13698 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CACNA1SQ13698 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
CACNA1SQ13698 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
CACNA1SQ13698 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CACNA1SQ13698 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CACNA1SQ13698 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
CACNA1SQ13698 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CACNA1SQ13698 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CACNA1SQ13698 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CACNA1SQ13698 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CACNA1SQ13698 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CACNA1SQ13698 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CACNA1SQ13698 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CACNA1SQ13698 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CACNA1SQ13698 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CACNA1SQ13698 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CACNA1SQ13698 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CACNA1SQ13698 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CACNA1SQ13698 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CACNA1SQ13698 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CACNA1SQ13698 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CACNA1SQ13698 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
CACNA1SQ13698 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
CACNA1SQ13698 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CACNA1SQ13698 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CACNA1SQ13698 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CACNA1SQ13698 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CACNA1SQ13698 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CACNA1SQ13698 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CACNA1SQ13698 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CACNA1SQ13698 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CACNA1SQ13698 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CACNA1SQ13698 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CACNA1SQ13698 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CACNA1SQ13698 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CACNA1SQ13698 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CACNA1SQ13698 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CACNA1SQ13698 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CACNA1SQ13698 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CACNA1SQ13698 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CACNA1SQ13698 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CACNA1SQ13698 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CACNA1SQ13698 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CACNA1SQ13698 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CACNA1SQ13698 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CACNA1SQ13698 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CACNA1SQ13698 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CACNA1SQ13698 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CACNA1SQ13698 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CACNA1SQ13698 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CACNA1SQ13698 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CACNA1SQ13698 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CACNA1SQ13698 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CACNA1SQ13698 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
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