Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MTMR3Q13615 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
MTMR3Q13615 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MTMR3Q13615 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MTMR3Q13615 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
MTMR3Q13615 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
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