Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 RABL6-208ENST00000464941 3361 ntTSL 214.42□□□□□ -0.12e-7■■■■■ 34
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TRA2AQ13595 ZCCHC8-209ENST00000546149 657 ntTSL 36.95□□□□□ -1.31e-10■■■■■ 33.8
TRA2AQ13595 ZCCHC8-204ENST00000538493 1142 ntTSL 45□□□□□ -1.611e-10■■■■■ 33.8
TRA2AQ13595 ZCCHC8-208ENST00000544054 1561 ntTSL 54.16□□□□□ -1.741e-10■■■■■ 33.8
TRA2AQ13595 PTMS-205ENST00000540828 644 ntTSL 1 (best)20.81■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 33.7
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TRA2AQ13595 PTMS-203ENST00000538057 976 ntTSL 219.59■□□□□ 0.732e-8■■■■■ 33.7
TRA2AQ13595 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 33.7
TRA2AQ13595 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 33.7
TRA2AQ13595 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 213.61□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 33.7
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TRA2AQ13595 RSL1D1-202ENST00000396503 1470 ntTSL 27.86□□□□□ -1.156e-8■■■■■ 33.7
TRA2AQ13595 RSL1D1-201ENST00000355674 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.3□□□□□ -1.246e-8■■■■■ 33.7
TRA2AQ13595 RSL1D1-207ENST00000573029 766 ntTSL 36.11□□□□□ -1.436e-8■■■■■ 33.7
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TRA2AQ13595 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 218.87■□□□□ 0.611e-7■■■■■ 33.7
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TRA2AQ13595 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 33.7
TRA2AQ13595 C9orf3-201ENST00000277198 1966 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.581e-7■■■■■ 33.7
TRA2AQ13595 CABIN1-203ENST00000398319 7480 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.731e-7■■■■■ 33.7
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TRA2AQ13595 CABIN1-204ENST00000405822 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.821e-7■■■■■ 33.7
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TRA2AQ13595 PGK1-202ENST00000474281 307 ntTSL 1 (best)4.1□□□□□ -1.753e-9■■■■■ 33.7
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TRA2AQ13595 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.45e-7■■■■■ 32.5
TRA2AQ13595 RBM25-212ENST00000532683 6848 ntTSL 1 (best)5.33□□□□□ -1.565e-7■■■■■ 32.5
TRA2AQ13595 RBM25-207ENST00000528081 3008 ntTSL 25.17□□□□□ -1.582e-7■■■■■ 32.5
TRA2AQ13595 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.695e-9■■■■■ 32.5
TRA2AQ13595 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.74e-7■■■■■ 32.4
TRA2AQ13595 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.953e-7■■■■■ 32.4
TRA2AQ13595 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.074e-7■■■■■ 32.4
TRA2AQ13595 MSH6-202ENST00000411819 548 ntTSL 422.1■■□□□ 1.136e-7■■■■■ 32.2
TRA2AQ13595 MSH6-206ENST00000455383 578 ntTSL 518.69■□□□□ 0.586e-7■■■■■ 32.2
TRA2AQ13595 MSH6-207ENST00000456246 846 ntTSL 317.68■□□□□ 0.426e-7■■■■■ 32.2
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TRA2AQ13595 MSH6-215ENST00000622629 4324 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.616e-7■■■■■ 32.2
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TRA2AQ13595 MSH6-213ENST00000614496 4150 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.696e-7■■■■■ 32.2
TRA2AQ13595 MSH6-204ENST00000445503 4158 ntTSL 1 (best)10.11□□□□□ -0.796e-7■■■■■ 32.2
TRA2AQ13595 MSH6-201ENST00000234420 7476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.876e-7■■■■■ 32.2
TRA2AQ13595 MSH6-209ENST00000538136 4055 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.346e-7■■■■■ 32.2
TRA2AQ13595 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.612e-6■■■■■ 32.1
TRA2AQ13595 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.642e-6■■■■■ 32.1
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