Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXE3Q13461 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
FOXE3Q13461 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXE3Q13461 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXE3Q13461 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
FOXE3Q13461 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXE3Q13461 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
FOXE3Q13461 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
FOXE3Q13461 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXE3Q13461 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
FOXE3Q13461 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXE3Q13461 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
FOXE3Q13461 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
FOXE3Q13461 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
FOXE3Q13461 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FOXE3Q13461 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FOXE3Q13461 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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