Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LSAMPQ13449 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LSAMPQ13449 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LSAMPQ13449 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LSAMPQ13449 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LSAMPQ13449 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms