Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
MKRN4PQ13434 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MKRN4PQ13434 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
MKRN4PQ13434 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MKRN4PQ13434 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
MKRN4PQ13434 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
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