Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Length 168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PMS2P3Q13401 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PMS2P3Q13401 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PMS2P3Q13401 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PMS2P3Q13401 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMS2P3Q13401 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
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