Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCGB2A2Q13296 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCGB2A2Q13296 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SCGB2A2Q13296 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCGB2A2Q13296 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCGB2A2Q13296 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCGB2A2Q13296 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCGB2A2Q13296 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCGB2A2Q13296 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SCGB2A2Q13296 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCGB2A2Q13296 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCGB2A2Q13296 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SCGB2A2Q13296 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SCGB2A2Q13296 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SCGB2A2Q13296 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCGB2A2Q13296 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCGB2A2Q13296 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCGB2A2Q13296 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SCGB2A2Q13296 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SCGB2A2Q13296 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SCGB2A2Q13296 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SCGB2A2Q13296 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms