Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
CHAF1AQ13111 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
CHAF1AQ13111 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
CHAF1AQ13111 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CHAF1AQ13111 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CHAF1AQ13111 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CHAF1AQ13111 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
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