Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
MKRN3Q13064 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
MKRN3Q13064 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
MKRN3Q13064 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MKRN3Q13064 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
MKRN3Q13064 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
MKRN3Q13064 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MKRN3Q13064 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
MKRN3Q13064 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
MKRN3Q13064 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
MKRN3Q13064 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
MKRN3Q13064 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
MKRN3Q13064 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
MKRN3Q13064 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
MKRN3Q13064 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
MKRN3Q13064 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
MKRN3Q13064 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MKRN3Q13064 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
MKRN3Q13064 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
MKRN3Q13064 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
MKRN3Q13064 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
MKRN3Q13064 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MKRN3Q13064 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MKRN3Q13064 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
MKRN3Q13064 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
MKRN3Q13064 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
MKRN3Q13064 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
MKRN3Q13064 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
MKRN3Q13064 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MKRN3Q13064 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
MKRN3Q13064 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MKRN3Q13064 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MKRN3Q13064 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
MKRN3Q13064 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MKRN3Q13064 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MKRN3Q13064 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MKRN3Q13064 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MKRN3Q13064 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MKRN3Q13064 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
MKRN3Q13064 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MKRN3Q13064 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
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