Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN13Q12923 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN13Q12923 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN13Q12923 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN13Q12923 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN13Q12923 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN13Q12923 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN13Q12923 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN13Q12923 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN13Q12923 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN13Q12923 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN13Q12923 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTPN13Q12923 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN13Q12923 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN13Q12923 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTPN13Q12923 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTPN13Q12923 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
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