Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 YRF1-2YER190W 5046 nt7.66□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 LYS20YDL182W 1287 nt7.65□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 CYC3YAL039C 810 nt7.65□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 YKR012CYKR012C 378 nt7.65□□□□□ -1.18
PRP46Q12417 VBA3YCL069W 1377 nt7.64□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 RPD3YNL330C 1302 nt7.64□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 HIS2YFR025C 1008 nt7.64□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 SER2YGR208W 930 nt7.64□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 SRP102YKL154W 735 nt7.64□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 GTB1YDR221W 2109 nt7.64□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 MOB1YIL106W 945 nt7.63□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 YKL053WYKL053W 375 nt7.63□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 SNX3YOR357C 489 nt7.63□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 SAN1YDR143C 1833 nt7.63□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 SSL2YIL143C 2532 nt7.62□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 GNP1YDR508C 1992 nt7.62□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 KRR1YCL059C 951 nt7.62□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 TOK1YJL093C 2076 nt7.61□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 ENO1YGR254W 1314 nt7.61□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 SRP54YPR088C 1626 nt7.61□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 HTS1YPR033C 1641 nt7.6□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 PUS7YOR243C 2031 nt7.59□□□□□ -1.19
PRP46Q12417 YPT11YNL304W 1254 nt7.58□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 RIM2YBR192W 1134 nt7.58□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 SOD2YHR008C 702 nt7.57□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 ERG6YML008C 1152 nt7.57□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 YMR007WYMR007W 381 nt7.57□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 KGD2YDR148C 1392 nt7.57□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 ERO1YML130C 1692 nt7.57□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 RPC31YNL151C 756 nt7.56□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 ODC1YPL134C 933 nt7.55□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 TPO4YOR273C 1980 nt7.55□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 YFR020WYFR020W 699 nt7.54□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 YLR280CYLR280C 351 nt7.54□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 POP2YNR052C 1302 nt7.53□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.53□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.53□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.53□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 YGR210CYGR210C 1236 nt7.53□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 HMG2YLR450W 3138 nt7.53□□□□□ -1.2
PRP46Q12417 YMR209CYMR209C 1374 nt7.52□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 SBP1YHL034C 885 nt7.52□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 DPL1YDR294C 1770 nt7.51□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 RCR1YBR005W 642 nt7.51□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 FRA1YLL029W 2250 nt7.51□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 GAS1YMR307W 1680 nt7.51□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.5□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 YPL108WYPL108W 507 nt7.5□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.49□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.49□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.49□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.49□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.49□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 MDM35YKL053C-A 261 nt7.49□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.49□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 Q0010Q0010 387 nt7.49□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 PTC6YCR079W 1329 nt7.48□□□□□ -1.21
PRP46Q12417 RSM7YJR113C 744 nt7.46□□□□□ -1.22
PRP46Q12417 YJL160CYJL160C 864 nt7.45□□□□□ -1.22
PRP46Q12417 GGA2YHR108W 1758 nt7.44□□□□□ -1.22
PRP46Q12417 YMR166CYMR166C 1107 nt7.44□□□□□ -1.22
PRP46Q12417 THI3YDL080C 1830 nt7.43□□□□□ -1.22
PRP46Q12417 YHL008CYHL008C 1884 nt7.42□□□□□ -1.22
PRP46Q12417 GPM1YKL152C 744 nt7.4□□□□□ -1.22
PRP46Q12417 FCY1YPR062W 477 nt7.4□□□□□ -1.22
PRP46Q12417 URA8YJR103W 1737 nt7.39□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.39□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.39□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 DMA2YNL116W 1569 nt7.38□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 PAU21YOR394W 495 nt7.38□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 PAU22YPL282C 495 nt7.38□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 LEU4YNL104C 1860 nt7.38□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 PSD1YNL169C 1503 nt7.37□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 EMC3YKL207W 762 nt7.37□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 AAC3YBR085W 924 nt7.37□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 OCH1YGL038C 1443 nt7.36□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 YDR467CYDR467C 327 nt7.36□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 YER156CYER156C 1017 nt7.36□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 RRT14YIL127C 621 nt7.36□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 YLR460CYLR460C 1131 nt7.36□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 MET22YOL064C 1074 nt7.36□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 YIL177CYIL177C 5277 nt7.36□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 TMS1YDR105C 1422 nt7.35□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 YMR210WYMR210W 1350 nt7.35□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 PET18YCR020C 648 nt7.35□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 CAK1YFL029C 1107 nt7.35□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 BUD20YLR074C 501 nt7.35□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 YOR343CYOR343C 327 nt7.35□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 LSP1YPL004C 1026 nt7.35□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 GRH1YDR517W 1119 nt7.34□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 CHS7YHR142W 951 nt7.34□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 YIR035CYIR035C 765 nt7.34□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 RNA170RNA170 169 nt7.34□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 CYT1YOR065W 930 nt7.34□□□□□ -1.23
PRP46Q12417 YHR218WYHR218W 1812 nt7.34□□□□□ -1.24
PRP46Q12417 HXK1YFR053C 1458 nt7.33□□□□□ -1.24
PRP46Q12417 INH1YDL181W 258 nt7.33□□□□□ -1.24
PRP46Q12417 PDC6YGR087C 1692 nt7.32□□□□□ -1.24
PRP46Q12417 HXT10YFL011W 1641 nt7.32□□□□□ -1.24
PRP46Q12417 HRA1HRA1 564 nt7.32□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.6 ms