Protein–RNA interactions for Protein: Q12234

RUD3, GRIP domain-containing protein RUD3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUD3Q12234 SWT21YNL187W 1074 nt8.9□□□□□ -0.98
RUD3Q12234 snR4snR4 186 nt8.9□□□□□ -0.98
RUD3Q12234 DUS3YLR401C 2007 nt8.9□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 MET1YKR069W 1782 nt8.89□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 TVP23YDR084C 600 nt8.89□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 RIB2YOL066C 1776 nt8.89□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt8.88□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 YNR029CYNR029C 1290 nt8.88□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 ADH1YOL086C 1047 nt8.88□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 THI3YDL080C 1830 nt8.88□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 POP2YNR052C 1302 nt8.87□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 GGA2YHR108W 1758 nt8.87□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 ADE16YLR028C 1776 nt8.87□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 ALR1YOL130W 2580 nt8.87□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 KGD2YDR148C 1392 nt8.86□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 YMR210WYMR210W 1350 nt8.86□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 YLR072WYLR072W 2082 nt8.86□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.84□□□□□ -0.99
RUD3Q12234 GCD11YER025W 1584 nt8.83□□□□□ -1
RUD3Q12234 FTH1YBR207W 1398 nt8.82□□□□□ -1
RUD3Q12234 DIA4YHR011W 1341 nt8.81□□□□□ -1
RUD3Q12234 SNU66YOR308C 1764 nt8.81□□□□□ -1
RUD3Q12234 YJL195CYJL195C 702 nt8.81□□□□□ -1
RUD3Q12234 MRS4YKR052C 915 nt8.81□□□□□ -1
RUD3Q12234 YRF1-1YDR545W 5391 nt8.81□□□□□ -1
RUD3Q12234 YRF1-5YLR467W 5391 nt8.81□□□□□ -1
RUD3Q12234 YRF1-8YOR396W 5391 nt8.81□□□□□ -1
RUD3Q12234 SBP1YHL034C 885 nt8.8□□□□□ -1
RUD3Q12234 ADE2YOR128C 1716 nt8.79□□□□□ -1
RUD3Q12234 SPS100YHR139C 981 nt8.78□□□□□ -1
RUD3Q12234 YKL053WYKL053W 375 nt8.78□□□□□ -1
RUD3Q12234 LPD1YFL018C 1500 nt8.78□□□□□ -1
RUD3Q12234 LEA1YPL213W 717 nt8.77□□□□□ -1.01
RUD3Q12234 YPR126CYPR126C 309 nt8.77□□□□□ -1.01
RUD3Q12234 SAN1YDR143C 1833 nt8.76□□□□□ -1.01
RUD3Q12234 ESS1YJR017C 513 nt8.76□□□□□ -1.01
RUD3Q12234 AMF1YOR378W 1548 nt8.75□□□□□ -1.01
RUD3Q12234 FUN14YAL008W 597 nt8.75□□□□□ -1.01
RUD3Q12234 SNZ1YMR096W 894 nt8.75□□□□□ -1.01
RUD3Q12234 AAC3YBR085W 924 nt8.75□□□□□ -1.01
RUD3Q12234 PFS2YNL317W 1398 nt8.74□□□□□ -1.01
RUD3Q12234 snR86snR86 1004 nt8.74□□□□□ -1.01
RUD3Q12234 ABZ2YMR289W 1125 nt8.72□□□□□ -1.01
RUD3Q12234 IML3YBR107C 738 nt8.72□□□□□ -1.01
RUD3Q12234 ENO2YHR174W 1314 nt8.71□□□□□ -1.02
RUD3Q12234 MAM3YOL060C 2121 nt8.7□□□□□ -1.02
RUD3Q12234 YEL008WYEL008W 381 nt8.69□□□□□ -1.02
RUD3Q12234 MDH2YOL126C 1134 nt8.69□□□□□ -1.02
RUD3Q12234 ABP1YCR088W 1779 nt8.68□□□□□ -1.02
RUD3Q12234 HIS3YOR202W 663 nt8.68□□□□□ -1.02
RUD3Q12234 HSV2YGR223C 1347 nt8.68□□□□□ -1.02
RUD3Q12234 CCT5YJR064W 1689 nt8.67□□□□□ -1.02
RUD3Q12234 CTI6YPL181W 1521 nt8.66□□□□□ -1.02
RUD3Q12234 TMS1YDR105C 1422 nt8.66□□□□□ -1.02
RUD3Q12234 SLM3YDL033C 1254 nt8.66□□□□□ -1.02
RUD3Q12234 ECM10YEL030W 1935 nt8.65□□□□□ -1.02
RUD3Q12234 STE4YOR212W 1272 nt8.65□□□□□ -1.02
RUD3Q12234 GAS1YMR307W 1680 nt8.64□□□□□ -1.03
RUD3Q12234 SRP54YPR088C 1626 nt8.64□□□□□ -1.03
RUD3Q12234 LEU2YCL018W 1095 nt8.63□□□□□ -1.03
RUD3Q12234 ADE5,7YGL234W 2409 nt8.61□□□□□ -1.03
RUD3Q12234 PAR32YDL173W 888 nt8.61□□□□□ -1.03
RUD3Q12234 PMT7YDR307W 1989 nt8.61□□□□□ -1.03
RUD3Q12234 MET30YIL046W 1923 nt8.6□□□□□ -1.03
RUD3Q12234 PTC6YCR079W 1329 nt8.6□□□□□ -1.03
RUD3Q12234 TPC1YGR096W 945 nt8.6□□□□□ -1.03
RUD3Q12234 YNL190WYNL190W 615 nt8.6□□□□□ -1.03
RUD3Q12234 YDR306CYDR306C 1437 nt8.6□□□□□ -1.03
RUD3Q12234 YJL009WYJL009W 327 nt8.59□□□□□ -1.03
RUD3Q12234 NDE2YDL085W 1638 nt8.58□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 LYS20YDL182W 1287 nt8.58□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 NAM8YHR086W 1572 nt8.57□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 TIF3YPR163C 1311 nt8.56□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 YLR349WYLR349W 507 nt8.56□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 TAF13YML098W 504 nt8.56□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 MHF1YOL086W-A 273 nt8.56□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 YBR056WYBR056W 1506 nt8.55□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 LAS17YOR181W 1902 nt8.55□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 REX2YLR059C 810 nt8.55□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 CPD1YGR247W 720 nt8.54□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 AIM34YMR003W 597 nt8.54□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 YNL140CYNL140C 570 nt8.54□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 YPT11YNL304W 1254 nt8.54□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt8.53□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 YEL023CYEL023C 2049 nt8.53□□□□□ -1.04
RUD3Q12234 ADH7YCR105W 1086 nt8.51□□□□□ -1.05
RUD3Q12234 ITR1YDR497C 1755 nt8.5□□□□□ -1.05
RUD3Q12234 MEP1YGR121C 1479 nt8.5□□□□□ -1.05
RUD3Q12234 GLY1YEL046C 1164 nt8.49□□□□□ -1.05
RUD3Q12234 YIR035CYIR035C 765 nt8.49□□□□□ -1.05
RUD3Q12234 BUD31YCR063W 474 nt8.48□□□□□ -1.05
RUD3Q12234 POT1YIL160C 1254 nt8.48□□□□□ -1.05
RUD3Q12234 PAU15YIR041W 375 nt8.48□□□□□ -1.05
RUD3Q12234 BUB2YMR055C 921 nt8.48□□□□□ -1.05
RUD3Q12234 PRC1YMR297W 1599 nt8.48□□□□□ -1.05
RUD3Q12234 MRN1YPL184C 1839 nt8.47□□□□□ -1.05
RUD3Q12234 RAD51YER095W 1203 nt8.47□□□□□ -1.05
RUD3Q12234 INM1YHR046C 888 nt8.47□□□□□ -1.05
RUD3Q12234 YJR149WYJR149W 1215 nt8.47□□□□□ -1.05
RUD3Q12234 YPL264CYPL264C 1062 nt8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 66.9 ms