Protein–RNA interactions for Protein: Q12230

LSP1, Sphingolipid long chain base-responsive protein LSP1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSP1Q12230 THI72YOR192C 1800 nt9.79□□□□□ -0.84
LSP1Q12230 MRS4YKR052C 915 nt9.79□□□□□ -0.84
LSP1Q12230 snR4snR4 186 nt9.79□□□□□ -0.84
LSP1Q12230 SAN1YDR143C 1833 nt9.77□□□□□ -0.84
LSP1Q12230 DUR3YHL016C 2208 nt9.76□□□□□ -0.85
LSP1Q12230 FTH1YBR207W 1398 nt9.76□□□□□ -0.85
LSP1Q12230 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.75□□□□□ -0.85
LSP1Q12230 TPN1YGL186C 1740 nt9.73□□□□□ -0.85
LSP1Q12230 YRF1-2YER190W 5046 nt9.73□□□□□ -0.85
LSP1Q12230 NAM8YHR086W 1572 nt9.72□□□□□ -0.85
LSP1Q12230 SRP54YPR088C 1626 nt9.72□□□□□ -0.85
LSP1Q12230 RFC1YOR217W 2586 nt9.72□□□□□ -0.85
LSP1Q12230 YJL195CYJL195C 702 nt9.71□□□□□ -0.86
LSP1Q12230 LEU2YCL018W 1095 nt9.71□□□□□ -0.86
LSP1Q12230 YMR210WYMR210W 1350 nt9.71□□□□□ -0.86
LSP1Q12230 snR86snR86 1004 nt9.69□□□□□ -0.86
LSP1Q12230 MHF1YOL086W-A 273 nt9.69□□□□□ -0.86
LSP1Q12230 PTC6YCR079W 1329 nt9.68□□□□□ -0.86
LSP1Q12230 DUS3YLR401C 2007 nt9.68□□□□□ -0.86
LSP1Q12230 GAS1YMR307W 1680 nt9.67□□□□□ -0.86
LSP1Q12230 TOK1YJL093C 2076 nt9.67□□□□□ -0.86
LSP1Q12230 UFD1YGR048W 1086 nt9.65□□□□□ -0.86
LSP1Q12230 LEA1YPL213W 717 nt9.65□□□□□ -0.86
LSP1Q12230 YLR072WYLR072W 2082 nt9.65□□□□□ -0.87
LSP1Q12230 SPE2YOL052C 1191 nt9.64□□□□□ -0.87
LSP1Q12230 POT1YIL160C 1254 nt9.63□□□□□ -0.87
LSP1Q12230 YJL009WYJL009W 327 nt9.63□□□□□ -0.87
LSP1Q12230 TAF13YML098W 504 nt9.63□□□□□ -0.87
LSP1Q12230 AAC3YBR085W 924 nt9.63□□□□□ -0.87
LSP1Q12230 FIT1YDR534C 1587 nt9.63□□□□□ -0.87
LSP1Q12230 POP2YNR052C 1302 nt9.62□□□□□ -0.87
LSP1Q12230 REX2YLR059C 810 nt9.62□□□□□ -0.87
LSP1Q12230 KRE1YNL322C 942 nt9.61□□□□□ -0.87
LSP1Q12230 ADE16YLR028C 1776 nt9.6□□□□□ -0.87
LSP1Q12230 ABP1YCR088W 1779 nt9.6□□□□□ -0.87
LSP1Q12230 MEP1YGR121C 1479 nt9.58□□□□□ -0.88
LSP1Q12230 LYS20YDL182W 1287 nt9.56□□□□□ -0.88
LSP1Q12230 HIS3YOR202W 663 nt9.56□□□□□ -0.88
LSP1Q12230 TMS1YDR105C 1422 nt9.56□□□□□ -0.88
LSP1Q12230 YEL008WYEL008W 381 nt9.55□□□□□ -0.88
LSP1Q12230 YJR149WYJR149W 1215 nt9.55□□□□□ -0.88
LSP1Q12230 FUN14YAL008W 597 nt9.54□□□□□ -0.88
LSP1Q12230 DIA4YHR011W 1341 nt9.54□□□□□ -0.88
LSP1Q12230 YKR012CYKR012C 378 nt9.53□□□□□ -0.88
LSP1Q12230 HSV2YGR223C 1347 nt9.52□□□□□ -0.89
LSP1Q12230 APS2YJR058C 444 nt9.51□□□□□ -0.89
LSP1Q12230 YPT11YNL304W 1254 nt9.51□□□□□ -0.89
LSP1Q12230 PAR32YDL173W 888 nt9.5□□□□□ -0.89
LSP1Q12230 NIF3YGL221C 867 nt9.5□□□□□ -0.89
LSP1Q12230 PFS2YNL317W 1398 nt9.5□□□□□ -0.89
LSP1Q12230 MDH2YOL126C 1134 nt9.48□□□□□ -0.89
LSP1Q12230 HEM14YER014W 1620 nt9.48□□□□□ -0.89
LSP1Q12230 INO1YJL153C 1602 nt9.48□□□□□ -0.89
LSP1Q12230 NAS2YIL007C 663 nt9.47□□□□□ -0.89
LSP1Q12230 YBR056WYBR056W 1506 nt9.46□□□□□ -0.9
LSP1Q12230 NDE2YDL085W 1638 nt9.45□□□□□ -0.9
LSP1Q12230 TUB4YLR212C 1422 nt9.44□□□□□ -0.9
LSP1Q12230 THP3YPR045C 1413 nt9.43□□□□□ -0.9
LSP1Q12230 GSF2YML048W 1212 nt9.43□□□□□ -0.9
LSP1Q12230 BUB2YMR055C 921 nt9.43□□□□□ -0.9
LSP1Q12230 YNL140CYNL140C 570 nt9.43□□□□□ -0.9
LSP1Q12230 RSM7YJR113C 744 nt9.42□□□□□ -0.9
LSP1Q12230 SDS24YBR214W 1584 nt9.41□□□□□ -0.9
LSP1Q12230 VBA3YCL069W 1377 nt9.39□□□□□ -0.91
LSP1Q12230 TIF3YPR163C 1311 nt9.39□□□□□ -0.91
LSP1Q12230 MRN1YPL184C 1839 nt9.38□□□□□ -0.91
LSP1Q12230 YIR035CYIR035C 765 nt9.38□□□□□ -0.91
LSP1Q12230 FSH2YMR222C 672 nt9.38□□□□□ -0.91
LSP1Q12230 LPD1YFL018C 1500 nt9.37□□□□□ -0.91
LSP1Q12230 BUD31YCR063W 474 nt9.36□□□□□ -0.91
LSP1Q12230 SLM3YDL033C 1254 nt9.36□□□□□ -0.91
LSP1Q12230 INM1YHR046C 888 nt9.35□□□□□ -0.91
LSP1Q12230 ADH3YMR083W 1128 nt9.35□□□□□ -0.91
LSP1Q12230 PMT7YDR307W 1989 nt9.34□□□□□ -0.91
LSP1Q12230 TGL5YOR081C 2250 nt9.34□□□□□ -0.91
LSP1Q12230 GLY1YEL046C 1164 nt9.33□□□□□ -0.92
LSP1Q12230 MOB1YIL106W 945 nt9.33□□□□□ -0.92
LSP1Q12230 PHB2YGR231C 933 nt9.32□□□□□ -0.92
LSP1Q12230 CDD1YLR245C 429 nt9.32□□□□□ -0.92
LSP1Q12230 YPL264CYPL264C 1062 nt9.32□□□□□ -0.92
LSP1Q12230 CPD1YGR247W 720 nt9.31□□□□□ -0.92
LSP1Q12230 ENO1YGR254W 1314 nt9.31□□□□□ -0.92
LSP1Q12230 STE4YOR212W 1272 nt9.3□□□□□ -0.92
LSP1Q12230 LRO1YNR008W 1986 nt9.3□□□□□ -0.92
LSP1Q12230 YFR020WYFR020W 699 nt9.29□□□□□ -0.92
LSP1Q12230 FRA1YLL029W 2250 nt9.29□□□□□ -0.92
LSP1Q12230 TDA4YJR116W 840 nt9.28□□□□□ -0.92
LSP1Q12230 MRP7YNL005C 1116 nt9.28□□□□□ -0.92
LSP1Q12230 TOM71YHR117W 1920 nt9.28□□□□□ -0.92
LSP1Q12230 WSC4YHL028W 1818 nt9.28□□□□□ -0.92
LSP1Q12230 DIP5YPL265W 1827 nt9.26□□□□□ -0.93
LSP1Q12230 EHT1YBR177C 1356 nt9.26□□□□□ -0.93
LSP1Q12230 YLR460CYLR460C 1131 nt9.26□□□□□ -0.93
LSP1Q12230 KTR4YBR199W 1395 nt9.25□□□□□ -0.93
LSP1Q12230 IGD1YFR017C 588 nt9.25□□□□□ -0.93
LSP1Q12230 AIM34YMR003W 597 nt9.25□□□□□ -0.93
LSP1Q12230 CHA1YCL064C 1083 nt9.24□□□□□ -0.93
LSP1Q12230 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt9.24□□□□□ -0.93
LSP1Q12230 MET13YGL125W 1803 nt9.24□□□□□ -0.93
LSP1Q12230 PAU5YFL020C 369 nt9.23□□□□□ -0.93
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