Protein–RNA interactions for Protein: Q12180

HAL9, Halotolerance protein 9, yeastyeast

Predictions only

Length 1,030 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HAL9Q12180 SUV3YPL029W 2214 nt8.2□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 FAF1YIL019W 1041 nt8.2□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 SWT21YNL187W 1074 nt8.2□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 TIP1YBR067C 633 nt8.2□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 KEL3YPL263C 1956 nt8.2□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 ENO2YHR174W 1314 nt8.2□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 TPC1YGR096W 945 nt8.19□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 TIM44YIL022W 1296 nt8.19□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 THP3YPR045C 1413 nt8.19□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 PAM17YKR065C 594 nt8.18□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 VMA11YPL234C 495 nt8.18□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 RPD3YNL330C 1302 nt8.18□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 KRE1YNL322C 942 nt8.17□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 SPE2YOL052C 1191 nt8.17□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 YMR265CYMR265C 1386 nt8.16□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 AGP3YFL055W 1677 nt8.15□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 HAP5YOR358W 729 nt8.15□□□□□ -1.1
HAL9Q12180 MET1YKR069W 1782 nt8.15□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 FSH2YMR222C 672 nt8.14□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 TOK1YJL093C 2076 nt8.14□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.13□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.13□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.13□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.13□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.13□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.13□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.13□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.13□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.13□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.13□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.13□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 PUS5YLR165C 765 nt8.13□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 LEU2YCL018W 1095 nt8.13□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 PHB2YGR231C 933 nt8.12□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt8.12□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 SNX3YOR357C 489 nt8.12□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 NAM8YHR086W 1572 nt8.12□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 NBA1YOL070C 1506 nt8.12□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 YOR072WYOR072W 315 nt8.11□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 CRC1YOR100C 984 nt8.11□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 IPL1YPL209C 1104 nt8.11□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 MTO1YGL236C 2010 nt8.11□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 YKL053WYKL053W 375 nt8.1□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 ADH3YMR083W 1128 nt8.1□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 snR31snR31 225 nt8.1□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 RPN14YGL004C 1254 nt8.09□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 FHN1YGR131W 525 nt8.09□□□□□ -1.11
HAL9Q12180 FLX1YIL134W 936 nt8.08□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 RIM2YBR192W 1134 nt8.08□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 MDL2YPL270W 2322 nt8.07□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 YCR025CYCR025C 411 nt8.07□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 RPC31YNL151C 756 nt8.07□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 FRA1YLL029W 2250 nt8.06□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 YCP4YCR004C 744 nt8.06□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 YKR012CYKR012C 378 nt8.06□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 DPL1YDR294C 1770 nt8.06□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 KRR1YCL059C 951 nt8.05□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 REX2YLR059C 810 nt8.05□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 SAN1YDR143C 1833 nt8.05□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 BNS1YGR230W 414 nt8.04□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 REC114YMR133W 1287 nt8.04□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 YHM2YMR241W 945 nt8.04□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 SDS24YBR214W 1584 nt8.04□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 MEX67YPL169C 1800 nt8.03□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 MOB1YIL106W 945 nt8.03□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 SRP54YPR088C 1626 nt8.03□□□□□ -1.12
HAL9Q12180 SAM50YNL026W 1455 nt8.02□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 KGD2YDR148C 1392 nt8.02□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 YIA6YIL006W 1122 nt8.02□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 RIB1YBL033C 1038 nt8.02□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 VBA3YCL069W 1377 nt8.01□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 CBK1YNL161W 2271 nt8.01□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 KDX1YKL161C 1302 nt8.01□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 LEU4YNL104C 1860 nt8□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 INH1YDL181W 258 nt8□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 LYS20YDL182W 1287 nt7.99□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 CYC3YAL039C 810 nt7.98□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 ATG17YLR423C 1254 nt7.98□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 FET5YFL041W 1869 nt7.98□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 SWM1YDR260C 513 nt7.97□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 SOD2YHR008C 702 nt7.97□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 YHR131CYHR131C 2553 nt7.97□□□□□ -1.13
HAL9Q12180 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 ERG6YML008C 1152 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 ENO1YGR254W 1314 nt7.96□□□□□ -1.14
HAL9Q12180 SER2YGR208W 930 nt7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms