Protein–RNA interactions for Protein: Q12009

TRM8, tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase, yeastyeast

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM8Q12009 TPC1YGR096W 945 nt8.34□□□□□ -1.07
TRM8Q12009 PHB2YGR231C 933 nt8.34□□□□□ -1.07
TRM8Q12009 YHR219WYHR219W 1875 nt8.34□□□□□ -1.07
TRM8Q12009 SFL1YOR140W 2301 nt8.32□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 SAM50YNL026W 1455 nt8.32□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 YLR173WYLR173W 1827 nt8.32□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 ADH3YMR083W 1128 nt8.32□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 LSR1LSR1 1175 nt8.32□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 MDL2YPL270W 2322 nt8.32□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 RTG2YGL252C 1767 nt8.32□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 NAS6YGR232W 687 nt8.31□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 LEU2YCL018W 1095 nt8.31□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 ITR2YOL103W 1830 nt8.31□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 SWM1YDR260C 513 nt8.3□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 KEL3YPL263C 1956 nt8.3□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 THI6YPL214C 1623 nt8.29□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 ELO1YJL196C 933 nt8.29□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 RPD3YNL330C 1302 nt8.29□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 LYS20YDL182W 1287 nt8.28□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 SOD2YHR008C 702 nt8.28□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 ERG6YML008C 1152 nt8.28□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 SWT21YNL187W 1074 nt8.28□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 ODC1YPL134C 933 nt8.28□□□□□ -1.08
TRM8Q12009 MOB1YIL106W 945 nt8.27□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 VMA11YPL234C 495 nt8.26□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 SUV3YPL029W 2214 nt8.26□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 NAM8YHR086W 1572 nt8.26□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 LPD1YFL018C 1500 nt8.25□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 SSL2YIL143C 2532 nt8.25□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 CYC3YAL039C 810 nt8.25□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 YKR012CYKR012C 378 nt8.25□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 SER2YGR208W 930 nt8.24□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 DMA2YNL116W 1569 nt8.23□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 SDS24YBR214W 1584 nt8.23□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 MET1YKR069W 1782 nt8.23□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 ALR1YOL130W 2580 nt8.23□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 HAP5YOR358W 729 nt8.22□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 snR31snR31 225 nt8.22□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 YMR265CYMR265C 1386 nt8.22□□□□□ -1.09
TRM8Q12009 SNX3YOR357C 489 nt8.21□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 MEX67YPL169C 1800 nt8.2□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 SRP102YKL154W 735 nt8.2□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 REX2YLR059C 810 nt8.2□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 HTS1YPR033C 1641 nt8.2□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 YMR007WYMR007W 381 nt8.19□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 VBA3YCL069W 1377 nt8.19□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 GCD11YER025W 1584 nt8.18□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 ENO1YGR254W 1314 nt8.18□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 POP2YNR052C 1302 nt8.18□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 RPN14YGL004C 1254 nt8.17□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 MDM35YKL053C-A 261 nt8.17□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 YKL053WYKL053W 375 nt8.17□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 CWP2YKL096W-A 279 nt8.17□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 CRC1YOR100C 984 nt8.17□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 YER152W-AYER152W-A 567 nt8.16□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 UFD1YGR048W 1086 nt8.15□□□□□ -1.1
TRM8Q12009 ERO1YML130C 1692 nt8.14□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 SRP54YPR088C 1626 nt8.14□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 RPC31YNL151C 756 nt8.14□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 SAN1YDR143C 1833 nt8.13□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 YGR210CYGR210C 1236 nt8.13□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 YLR280CYLR280C 351 nt8.13□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 RCR1YBR005W 642 nt8.13□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 CBK1YNL161W 2271 nt8.12□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 DUR3YHL016C 2208 nt8.11□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 HXT10YFL011W 1641 nt8.11□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 ADE2YOR128C 1716 nt8.1□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 KRR1YCL059C 951 nt8.1□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 TGA1tA(UGC)A 73 nt8.1□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt8.1□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt8.1□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt8.1□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt8.1□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 YPT11YNL304W 1254 nt8.1□□□□□ -1.11
TRM8Q12009 YFR020WYFR020W 699 nt8.08□□□□□ -1.12
TRM8Q12009 RIM2YBR192W 1134 nt8.08□□□□□ -1.12
TRM8Q12009 KGD2YDR148C 1392 nt8.08□□□□□ -1.12
TRM8Q12009 YPL108WYPL108W 507 nt8.07□□□□□ -1.12
TRM8Q12009 DPL1YDR294C 1770 nt8.07□□□□□ -1.12
TRM8Q12009 SNU66YOR308C 1764 nt8.07□□□□□ -1.12
TRM8Q12009 YHR218WYHR218W 1812 nt8.06□□□□□ -1.12
TRM8Q12009 ECM10YEL030W 1935 nt8.06□□□□□ -1.12
TRM8Q12009 FCY1YPR062W 477 nt8.05□□□□□ -1.12
TRM8Q12009 LEU4YNL104C 1860 nt8.04□□□□□ -1.12
TRM8Q12009 GAS1YMR307W 1680 nt8.03□□□□□ -1.12
TRM8Q12009 INH1YDL181W 258 nt8.03□□□□□ -1.12
TRM8Q12009 YDR467CYDR467C 327 nt8.03□□□□□ -1.12
TRM8Q12009 BUD20YLR074C 501 nt8.03□□□□□ -1.12
TRM8Q12009 YPL041CYPL041C 624 nt8.03□□□□□ -1.12
TRM8Q12009 MAM3YOL060C 2121 nt8.02□□□□□ -1.13
TRM8Q12009 SBP1YHL034C 885 nt8.02□□□□□ -1.13
TRM8Q12009 YJL160CYJL160C 864 nt8.02□□□□□ -1.13
TRM8Q12009 YHR131CYHR131C 2553 nt8.01□□□□□ -1.13
TRM8Q12009 FIT1YDR534C 1587 nt8.01□□□□□ -1.13
TRM8Q12009 PTC6YCR079W 1329 nt8.01□□□□□ -1.13
TRM8Q12009 AGP3YFL055W 1677 nt8□□□□□ -1.13
TRM8Q12009 RSM7YJR113C 744 nt8□□□□□ -1.13
TRM8Q12009 MET30YIL046W 1923 nt7.99□□□□□ -1.13
TRM8Q12009 MLS1YNL117W 1665 nt7.99□□□□□ -1.13
TRM8Q12009 PAU21YOR394W 495 nt7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.7 ms