Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCBP1Q09161 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
NCBP1Q09161 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NCBP1Q09161 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCBP1Q09161 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NCBP1Q09161 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCBP1Q09161 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCBP1Q09161 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCBP1Q09161 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCBP1Q09161 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCBP1Q09161 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP1Q09161 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP1Q09161 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP1Q09161 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP1Q09161 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NCBP1Q09161 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCBP1Q09161 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NCBP1Q09161 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCBP1Q09161 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCBP1Q09161 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms