Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
DDR1Q08345 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
DDR1Q08345 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
DDR1Q08345 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DDR1Q08345 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
DDR1Q08345 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
DDR1Q08345 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
DDR1Q08345 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
DDR1Q08345 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
DDR1Q08345 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
DDR1Q08345 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC33■■■□□ 2.87
DDR1Q08345 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
DDR1Q08345 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DDR1Q08345 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
DDR1Q08345 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDR1Q08345 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDR1Q08345 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDR1Q08345 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDR1Q08345 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
DDR1Q08345 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
DDR1Q08345 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
DDR1Q08345 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
DDR1Q08345 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
DDR1Q08345 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
DDR1Q08345 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DDR1Q08345 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
DDR1Q08345 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
DDR1Q08345 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
DDR1Q08345 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
DDR1Q08345 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
DDR1Q08345 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DDR1Q08345 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
DDR1Q08345 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
DDR1Q08345 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
DDR1Q08345 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
DDR1Q08345 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
DDR1Q08345 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
DDR1Q08345 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms