Protein–RNA interactions for Protein: Q07955

SRSF1, Serine/arginine-rich splicing factor 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1Q07955 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.741e-9■■■■■ 28.3
SRSF1Q07955 ZNF326-204ENST00000394583 1956 ntTSL 1 (best)15.45■□□□□ 0.064e-7■■■■■ 28.3
SRSF1Q07955 ZNF326-201ENST00000340281 2729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.894e-7■■■■■ 28.3
SRSF1Q07955 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 28.3
SRSF1Q07955 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.762e-9■■■■■ 28.2
SRSF1Q07955 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.382e-9■■■■■ 28.2
SRSF1Q07955 C19orf25-212ENST00000592605 357 ntTSL 317■□□□□ 0.312e-9■■■■■ 28.2
SRSF1Q07955 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 28.2
SRSF1Q07955 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.192e-9■■■■■ 28.2
SRSF1Q07955 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.162e-9■■■■■ 28.2
SRSF1Q07955 C19orf25-208ENST00000589421 492 ntTSL 215.31■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 28.2
SRSF1Q07955 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-9■■■■■ 28.2
SRSF1Q07955 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.012e-9■■■■■ 28.2
SRSF1Q07955 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.112e-9■■■■■ 28.2
SRSF1Q07955 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 28.2
SRSF1Q07955 C19orf25-209ENST00000590621 885 ntTSL 313.05□□□□□ -0.322e-9■■■■■ 28.2
SRSF1Q07955 ZNF789-212ENST00000494186 411 ntTSL 210.2□□□□□ -0.783e-13■■■■■ 28.2
SRSF1Q07955 ZNF789-207ENST00000481108 1018 ntTSL 1 (best)5.79□□□□□ -1.483e-13■■■■■ 28.2
SRSF1Q07955 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 28
SRSF1Q07955 SS18L1-205ENST00000492466 899 ntTSL 514.21□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 28
SRSF1Q07955 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 28
SRSF1Q07955 STARD3-229ENST00000585269 1346 ntTSL 520.31■□□□□ 0.846e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 ZCCHC11-217ENST00000524582 539 ntTSL 418.87■□□□□ 0.616e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 ZCCHC11-208ENST00000470626 883 ntTSL 318.33■□□□□ 0.526e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 STARD3-214ENST00000578577 1511 ntTSL 218.13■□□□□ 0.496e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.286e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.176e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 STARD3-211ENST00000578232 851 ntTSL 216.06■□□□□ 0.166e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.156e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.16e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 ZCCHC11-210ENST00000473856 2047 ntTSL 1 (best)15.29■□□□□ 0.046e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.016e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 STARD3-205ENST00000471896 2129 ntTSL 214.21□□□□□ -0.136e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 MYO19-218ENST00000617189 1990 ntTSL 213.16□□□□□ -0.36e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 STARD3-227ENST00000584850 2442 ntTSL 212.82□□□□□ -0.366e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 STARD3-226ENST00000583884 602 ntTSL 312.06□□□□□ -0.486e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 STARD3-208ENST00000488876 2404 ntTSL 212.05□□□□□ -0.486e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 ZCCHC11-202ENST00000355809 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.766e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 STARD3-206ENST00000481171 3451 ntTSL 29.13□□□□□ -0.956e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 MYO19-207ENST00000611622 4226 ntTSL 1 (best)8.55□□□□□ -1.046e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 BIRC6-201ENST00000421745 15703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.476e-8■■■■■ 28
SRSF1Q07955 LONP1-210ENST00000590511 722 ntTSL 323.28■■□□□ 1.329e-9■■■■■ 28
SRSF1Q07955 LONP1-212ENST00000590728 591 ntTSL 422.3■■□□□ 1.169e-9■■■■■ 28
SRSF1Q07955 CCDC88B-208ENST00000492980 2118 ntTSL 516.37■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 28
SRSF1Q07955 CCDC88B-210ENST00000494566 2909 ntTSL 212.44□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 28
SRSF1Q07955 CTTN-209ENST00000525276 584 ntTSL 311.34□□□□□ -0.599e-9■■■■■ 28
SRSF1Q07955 DSCR4-201ENST00000328264 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.949e-9■■■■■ 28
SRSF1Q07955 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.119e-9■■■■■ 28
SRSF1Q07955 AFDN-210ENST00000423229 1807 ntTSL 1 (best)7.03□□□□□ -1.289e-9■■■■■ 28
SRSF1Q07955 ZNF841-206ENST00000599430 389 ntTSL 26.24□□□□□ -1.419e-9■■■■■ 28
SRSF1Q07955 DSCR4-203ENST00000482032 799 ntTSL 33.84□□□□□ -1.799e-9■■■■■ 28
SRSF1Q07955 AFDN-216ENST00000503021 581 ntTSL 43.79□□□□□ -1.89e-9■■■■■ 28
SRSF1Q07955 LARS-204ENST00000504323 608 ntTSL 38.67□□□□□ -1.029e-8■■■■■ 27.9
SRSF1Q07955 LARS-210ENST00000508667 707 ntTSL 38.02□□□□□ -1.139e-8■■■■■ 27.9
SRSF1Q07955 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.179e-8■■■■■ 27.9
SRSF1Q07955 LARS-215ENST00000514104 509 ntTSL 25.93□□□□□ -1.469e-8■■■■■ 27.9
SRSF1Q07955 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.549e-8■■■■■ 27.9
SRSF1Q07955 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.579e-8■■■■■ 27.9
SRSF1Q07955 LARS-209ENST00000507095 384 ntTSL 34.67□□□□□ -1.669e-8■■■■■ 27.9
SRSF1Q07955 LRRC8B-204ENST00000449440 763 ntTSL 322.86■■□□□ 1.256e-8■■■■■ 27.9
SRSF1Q07955 LRRC8B-206ENST00000640258 8034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.356e-8■■■■■ 27.9
SRSF1Q07955 LRRC8B-205ENST00000639264 7736 ntAPPRIS P1 TSL 55.25□□□□□ -1.576e-8■■■■■ 27.9
SRSF1Q07955 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.656e-8■■■■■ 27.9
SRSF1Q07955 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.452e-8■■■■■ 27.7
SRSF1Q07955 ZWINT-208ENST00000489649 1621 ntTSL 512.17□□□□□ -0.462e-8■■■■■ 27.7
SRSF1Q07955 ZWINT-209ENST00000494312 1961 ntTSL 211.16□□□□□ -0.622e-8■■■■■ 27.7
SRSF1Q07955 ZWINT-203ENST00000373944 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 27.7
SRSF1Q07955 ZWINT-204ENST00000395405 1851 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.952e-8■■■■■ 27.7
SRSF1Q07955 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.535e-9■■■■■ 27.7
SRSF1Q07955 PSRC1-208ENST00000429031 835 ntTSL 319.94■□□□□ 0.781e-7■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 PSRC1-210ENST00000471740 738 ntTSL 318.25■□□□□ 0.511e-7■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 PSRC1-209ENST00000459765 839 ntTSL 217.8■□□□□ 0.441e-7■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 PSRC1-207ENST00000418914 1040 ntTSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 POLE-208ENST00000535934 1561 ntTSL 513.46□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 POLE-222ENST00000545015 366 ntTSL 212.64□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 TIMM10B-202ENST00000528908 593 ntTSL 1 (best)13.72□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 TIMM10B-203ENST00000530751 809 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.792e-8■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 NTRK1-208ENST00000531606 642 ntTSL 314.5□□□□□ -0.092e-8■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 NTRK1-205ENST00000497019 2508 ntTSL 214.24□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.162e-8■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.292e-8■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 NTRK1-207ENST00000530298 3052 ntTSL 211.34□□□□□ -0.592e-8■■■■■ 27.5
SRSF1Q07955 ZNF704-204ENST00000519936 712 ntTSL 519.77■□□□□ 0.768e-9■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 NASP-208ENST00000470768 1036 ntTSL 312.38□□□□□ -0.438e-9■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 SUPT16H-202ENST00000552829 669 ntTSL 212.02□□□□□ -0.498e-9■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 NASP-211ENST00000525515 565 ntTSL 510.97□□□□□ -0.658e-9■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 NASP-205ENST00000437901 874 ntTSL 510.75□□□□□ -0.698e-9■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 ZWINT-206ENST00000467523 663 ntTSL 510.73□□□□□ -0.693e-8■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 NASP-212ENST00000527359 743 ntTSL 310.59□□□□□ -0.718e-9■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 NASP-204ENST00000437362 999 ntTSL 210.52□□□□□ -0.738e-9■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 NASP-216ENST00000528238 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.71□□□□□ -0.868e-9■■■■■ 27.4
SRSF1Q07955 NASP-202ENST00000351223 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.878e-9■■■■■ 27.4
Retrieved 100 of 14,836 protein–RNA pairs in 238.1 ms