Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.342e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.282e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.262e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.222e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.22e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-285ENST00000627152 846 ntTSL 515.87■□□□□ 0.132e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 TRAPPC12-207ENST00000433382 578 ntTSL 515.58■□□□□ 0.082e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.082e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-236ENST00000599448 780 ntTSL 515.29■□□□□ 0.042e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-342ENST00000631366 751 ntTSL 515.29■□□□□ 0.042e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-263ENST00000626007 839 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.012e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-331ENST00000630863 954 ntTSL 514.91□□□□□ -0.022e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-320ENST00000629823 869 ntTSL 514.89□□□□□ -0.032e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-247ENST00000608737 956 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.032e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-204ENST00000420851 868 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.042e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-296ENST00000627718 510 ntTSL 514.79□□□□□ -0.042e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 TRAPPC12-218ENST00000479897 454 ntTSL 314.76□□□□□ -0.052e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-336ENST00000631189 1156 ntTSL 514.33□□□□□ -0.122e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 ATXN10-201ENST00000252934 3329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.172e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 TRAPPC12-219ENST00000479955 420 ntTSL 313.81□□□□□ -0.22e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-229ENST00000596584 863 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-225ENST00000594715 729 ntTSL 513.58□□□□□ -0.242e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-272ENST00000626569 857 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-213ENST00000445707 2363 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.332e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-216ENST00000451228 604 ntTSL 312.98□□□□□ -0.332e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-281ENST00000626969 745 ntTSL 512.53□□□□□ -0.42e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-230ENST00000597034 731 ntTSL 512.47□□□□□ -0.412e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-274ENST00000626617 1014 ntTSL 512.28□□□□□ -0.442e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 RFWD3-209ENST00000575154 547 ntTSL 312.27□□□□□ -0.452e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-327ENST00000630417 918 ntTSL 511.94□□□□□ -0.52e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 ATXN10-204ENST00000435026 653 ntTSL 311.88□□□□□ -0.512e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-259ENST00000625776 911 ntTSL 511.81□□□□□ -0.522e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 TRAPPC12-214ENST00000462983 543 ntTSL 411.28□□□□□ -0.62e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-293ENST00000627562 1184 ntTSL 510.97□□□□□ -0.652e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-208ENST00000431767 486 ntTSL 510.59□□□□□ -0.712e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-335ENST00000631105 702 ntTSL 510.56□□□□□ -0.722e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 ATP1A1-205ENST00000440951 579 ntTSL 510.01□□□□□ -0.812e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-290ENST00000627502 874 ntTSL 59.98□□□□□ -0.812e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-304ENST00000628301 772 ntTSL 59.52□□□□□ -0.892e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-308ENST00000628547 882 ntTSL 59.35□□□□□ -0.912e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-288ENST00000627363 731 ntTSL 59.31□□□□□ -0.922e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.932e-11■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-317ENST00000629686 669 ntTSL 59.12□□□□□ -0.952e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-252ENST00000620737 702 ntTSL 59.12□□□□□ -0.952e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 ATXN10-205ENST00000451241 514 ntTSL 39.02□□□□□ -0.972e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-215ENST00000451216 405 ntTSL 58.93□□□□□ -0.982e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-324ENST00000630243 955 ntTSL 58.6□□□□□ -1.032e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-267ENST00000626178 342 ntTSL 57.82□□□□□ -1.162e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 ATXN10-210ENST00000493643 617 ntTSL 57.59□□□□□ -1.192e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.322e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 PUS7-205ENST00000482157 395 ntTSL 56.63□□□□□ -1.352e-13■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 LINC00969-251ENST00000618708 606 ntTSL 56.28□□□□□ -1.42e-17■■■■■ 47.4
FMR1Q06787 SIRT7-210ENST00000572902 909 ntTSL 326.37■■□□□ 1.818e-18■■■■■ 47.3
FMR1Q06787 AC069277.1-203ENST00000414603 517 ntTSL 311.88□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 47.2
FMR1Q06787 ANKRD11-204ENST00000378332 1982 ntTSL 223.72■■□□□ 1.392e-12■■■■■ 47.1
FMR1Q06787 ANKRD11-207ENST00000562816 573 ntTSL 414.94□□□□□ -0.022e-12■■■■■ 47.1
FMR1Q06787 ZNF665-202ENST00000596373 616 ntTSL 517.56■□□□□ 0.49e-9■■■■■ 47.1
FMR1Q06787 ZNF665-206ENST00000600412 2273 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.49e-9■■■■■ 47.1
FMR1Q06787 ZNF665-205ENST00000598440 2352 ntTSL 212.42□□□□□ -0.429e-9■■■■■ 47.1
FMR1Q06787 ZNF665-201ENST00000396424 4159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.919e-9■■■■■ 47.1
FMR1Q06787 ZNF665-204ENST00000597544 552 ntTSL 38.05□□□□□ -1.129e-9■■■■■ 47.1
FMR1Q06787 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.11e-7■■■■■ 46.7
FMR1Q06787 AC069277.1-204ENST00000342990 246 ntTSL 310.95□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 46.4
FMR1Q06787 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.044e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 FAM208B-205ENST00000473789 506 ntTSL 530.85■■■□□ 2.534e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 FAM208B-210ENST00000496681 522 ntTSL 330.06■■■□□ 2.44e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 R3HDM2-208ENST00000448732 195 ntTSL 1 (best)29.99■■■□□ 2.394e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.994e-8■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.774e-8■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 FAM208B-207ENST00000480839 540 ntTSL 324.47■■□□□ 1.514e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.294e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 VPS53-218ENST00000575207 575 ntTSL 422.97■■□□□ 1.274e-8■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.264e-8■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 FAM208B-206ENST00000477043 514 ntTSL 221.05■□□□□ 0.964e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 VPS53-215ENST00000573028 3204 ntTSL 219.61■□□□□ 0.734e-8■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.74e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.414e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 HSPB11-204ENST00000371378 894 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.054e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 NAA38-202ENST00000570555 783 ntTSL 515.06■□□□□ 04e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.034e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 R3HDM2-215ENST00000634871 4092 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.044e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 CSAG4-201ENST00000361201 755 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.194e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 HSPB11-203ENST00000371377 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.264e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.454e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 VPS53-202ENST00000389040 1903 ntTSL 1 (best)12.01□□□□□ -0.494e-8■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 VPS53-203ENST00000401468 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.544e-8■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 MIR548XHG-201ENST00000355189 673 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.764e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 MIR548XHG-202ENST00000414582 615 ntTSL 38.72□□□□□ -1.014e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 VPS53-219ENST00000576019 613 ntTSL 38.23□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.254e-8■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 ESYT1-205ENST00000550179 576 ntTSL 47.07□□□□□ -1.284e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.444e-13■■■■■ 46.3
FMR1Q06787 CAPZB-208ENST00000482808 660 ntTSL 220.3■□□□□ 0.849e-9■■■■■ 46
FMR1Q06787 MITF-202ENST00000314589 1993 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.649e-9■■■■■ 46
FMR1Q06787 MITF-210ENST00000451708 1116 ntTSL 59.45□□□□□ -0.99e-9■■■■■ 46
FMR1Q06787 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.8□□□□□ -1.641e-323■■■■■ 46
FMR1Q06787 PRRG1-206ENST00000484460 582 ntTSL 422.04■■□□□ 1.123e-7■■■■■ 45.8
FMR1Q06787 PRRG1-204ENST00000466533 628 ntTSL 321.79■■□□□ 1.083e-7■■■■■ 45.8
FMR1Q06787 PRRG1-207ENST00000491253 650 ntTSL 313.65□□□□□ -0.223e-7■■■■■ 45.8
FMR1Q06787 PRRG1-209ENST00000543642 4509 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 45.8
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 479.7 ms