Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DEUP1Q05D60 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DEUP1Q05D60 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DEUP1Q05D60 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
DEUP1Q05D60 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DEUP1Q05D60 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
DEUP1Q05D60 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
DEUP1Q05D60 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
DEUP1Q05D60 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DEUP1Q05D60 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DEUP1Q05D60 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DEUP1Q05D60 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms