Protein–RNA interactions for Protein: Q04695

KRT17, Keratin, type I cytoskeletal 17, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT17Q04695 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT17Q04695 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT17Q04695 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT17Q04695 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT17Q04695 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT17Q04695 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms