Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CFHR1Q03591 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFHR1Q03591 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFHR1Q03591 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFHR1Q03591 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFHR1Q03591 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFHR1Q03591 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFHR1Q03591 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFHR1Q03591 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFHR1Q03591 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFHR1Q03591 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFHR1Q03591 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CFHR1Q03591 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CFHR1Q03591 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CFHR1Q03591 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CFHR1Q03591 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CFHR1Q03591 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CFHR1Q03591 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms