Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NHLH2Q02577 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
NHLH2Q02577 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
NHLH2Q02577 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NHLH2Q02577 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NHLH2Q02577 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms