Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAX5Q02548 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAX5Q02548 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PAX5Q02548 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAX5Q02548 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAX5Q02548 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms