Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP27A1Q02318 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP27A1Q02318 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP27A1Q02318 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP27A1Q02318 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP27A1Q02318 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP27A1Q02318 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms