Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CENPEQ02224 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPEQ02224 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPEQ02224 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPEQ02224 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CENPEQ02224 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPEQ02224 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPEQ02224 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CENPEQ02224 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CENPEQ02224 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPEQ02224 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CENPEQ02224 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CENPEQ02224 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPEQ02224 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms