Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD83Q01151 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD83Q01151 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD83Q01151 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CD83Q01151 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD83Q01151 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD83Q01151 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD83Q01151 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD83Q01151 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD83Q01151 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CD83Q01151 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD83Q01151 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CD83Q01151 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD83Q01151 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD83Q01151 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CD83Q01151 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD83Q01151 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD83Q01151 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CD83Q01151 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD83Q01151 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD83Q01151 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD83Q01151 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CD83Q01151 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD83Q01151 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CD83Q01151 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD83Q01151 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD83Q01151 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CD83Q01151 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD83Q01151 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD83Q01151 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD83Q01151 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CD83Q01151 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD83Q01151 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CD83Q01151 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD83Q01151 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD83Q01151 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD83Q01151 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD83Q01151 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CD83Q01151 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD83Q01151 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD83Q01151 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD83Q01151 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD83Q01151 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CD83Q01151 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD83Q01151 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD83Q01151 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CD83Q01151 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD83Q01151 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD83Q01151 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD83Q01151 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CD83Q01151 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CD83Q01151 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CD83Q01151 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD83Q01151 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD83Q01151 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CD83Q01151 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CD83Q01151 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD83Q01151 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CD83Q01151 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD83Q01151 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CD83Q01151 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD83Q01151 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD83Q01151 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD83Q01151 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD83Q01151 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CD83Q01151 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CD83Q01151 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD83Q01151 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD83Q01151 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD83Q01151 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CD83Q01151 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CD83Q01151 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CD83Q01151 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD83Q01151 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD83Q01151 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD83Q01151 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CD83Q01151 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD83Q01151 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD83Q01151 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CD83Q01151 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD83Q01151 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CD83Q01151 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD83Q01151 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD83Q01151 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CD83Q01151 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD83Q01151 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CD83Q01151 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD83Q01151 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD83Q01151 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD83Q01151 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD83Q01151 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CD83Q01151 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CD83Q01151 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CD83Q01151 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD83Q01151 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD83Q01151 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD83Q01151 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD83Q01151 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD83Q01151 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CD83Q01151 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms