Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SKOR1P84550 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SKOR1P84550 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SKOR1P84550 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SKOR1P84550 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKOR1P84550 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKOR1P84550 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SKOR1P84550 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKOR1P84550 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SKOR1P84550 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SKOR1P84550 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SKOR1P84550 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKOR1P84550 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKOR1P84550 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKOR1P84550 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKOR1P84550 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKOR1P84550 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SKOR1P84550 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SKOR1P84550 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms