Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HTRA4P83105 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HTRA4P83105 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HTRA4P83105 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HTRA4P83105 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HTRA4P83105 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HTRA4P83105 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTRA4P83105 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTRA4P83105 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTRA4P83105 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HTRA4P83105 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HTRA4P83105 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HTRA4P83105 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTRA4P83105 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTRA4P83105 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTRA4P83105 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTRA4P83105 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HTRA4P83105 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HTRA4P83105 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
HTRA4P83105 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HTRA4P83105 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
HTRA4P83105 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HTRA4P83105 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HTRA4P83105 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HTRA4P83105 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HTRA4P83105 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HTRA4P83105 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HTRA4P83105 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HTRA4P83105 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTRA4P83105 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HTRA4P83105 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HTRA4P83105 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HTRA4P83105 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HTRA4P83105 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HTRA4P83105 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HTRA4P83105 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HTRA4P83105 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTRA4P83105 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTRA4P83105 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTRA4P83105 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTRA4P83105 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTRA4P83105 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTRA4P83105 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTRA4P83105 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTRA4P83105 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms