Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CRB1P82279 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CRB1P82279 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CRB1P82279 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CRB1P82279 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CRB1P82279 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
CRB1P82279 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
CRB1P82279 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
CRB1P82279 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CRB1P82279 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
CRB1P82279 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CRB1P82279 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CRB1P82279 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CRB1P82279 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CRB1P82279 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CRB1P82279 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CRB1P82279 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CRB1P82279 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CRB1P82279 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
CRB1P82279 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CRB1P82279 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CRB1P82279 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CRB1P82279 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CRB1P82279 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CRB1P82279 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CRB1P82279 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CRB1P82279 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CRB1P82279 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CRB1P82279 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CRB1P82279 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CRB1P82279 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CRB1P82279 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CRB1P82279 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CRB1P82279 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CRB1P82279 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CRB1P82279 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CRB1P82279 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CRB1P82279 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CRB1P82279 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
CRB1P82279 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CRB1P82279 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CRB1P82279 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CRB1P82279 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CRB1P82279 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
CRB1P82279 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CRB1P82279 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CRB1P82279 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CRB1P82279 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CRB1P82279 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CRB1P82279 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CRB1P82279 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CRB1P82279 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CRB1P82279 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CRB1P82279 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CRB1P82279 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CRB1P82279 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CRB1P82279 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CRB1P82279 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CRB1P82279 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CRB1P82279 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CRB1P82279 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CRB1P82279 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CRB1P82279 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CRB1P82279 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CRB1P82279 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CRB1P82279 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CRB1P82279 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CRB1P82279 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CRB1P82279 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CRB1P82279 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CRB1P82279 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CRB1P82279 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CRB1P82279 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CRB1P82279 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
CRB1P82279 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CRB1P82279 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CRB1P82279 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CRB1P82279 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
CRB1P82279 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CRB1P82279 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CRB1P82279 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CRB1P82279 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CRB1P82279 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CRB1P82279 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CRB1P82279 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CRB1P82279 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CRB1P82279 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CRB1P82279 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CRB1P82279 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CRB1P82279 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CRB1P82279 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CRB1P82279 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CRB1P82279 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CRB1P82279 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CRB1P82279 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CRB1P82279 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CRB1P82279 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CRB1P82279 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CRB1P82279 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CRB1P82279 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms