Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAMEP78395 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRAMEP78395 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEP78395 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PRAMEP78395 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PRAMEP78395 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEP78395 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms